Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms