Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9DA42 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9DA42 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DA42 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9DA42 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9DA42 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9DA42 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9DA42 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9DA42 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9DA42 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9DA42 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9DA42 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9DA42 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9DA42 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9DA42 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9DA42 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9DA42 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9DA42 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9DA42 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9DA42 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9DA42 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9DA42 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9DA42 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9DA42 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9DA42 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9DA42 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9DA42 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9DA42 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9DA42 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9DA42 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9DA42 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9DA42 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9DA42 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9DA42 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9DA42 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9DA42 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9DA42 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9DA42 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9DA42 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9DA42 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9DA42 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9DA42 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9DA42 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9DA42 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9DA42 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9DA42 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9DA42 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9DA42 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9DA42 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DA42 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DA42 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DA42 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DA42 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DA42 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DA42 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DA42 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DA42 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DA42 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DA42 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DA42 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DA42 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DA42 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DA42 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DA42 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DA42 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DA42 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DA42 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DA42 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms