Protein–RNA interactions for Protein: Q9D848

AY761184, CRS1C-3, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY761184Q9D848 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AY761184Q9D848 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AY761184Q9D848 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AY761184Q9D848 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AY761184Q9D848 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AY761184Q9D848 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AY761184Q9D848 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AY761184Q9D848 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AY761184Q9D848 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AY761184Q9D848 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AY761184Q9D848 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AY761184Q9D848 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AY761184Q9D848 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AY761184Q9D848 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AY761184Q9D848 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AY761184Q9D848 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AY761184Q9D848 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AY761184Q9D848 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AY761184Q9D848 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AY761184Q9D848 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AY761184Q9D848 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AY761184Q9D848 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AY761184Q9D848 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AY761184Q9D848 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AY761184Q9D848 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AY761184Q9D848 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AY761184Q9D848 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AY761184Q9D848 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms