Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2c55Q9D816 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2c55Q9D816 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms