Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Z6

Clca1, Calcium-activated chloride channel regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca1Q9D7Z6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Clca1Q9D7Z6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Clca1Q9D7Z6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Clca1Q9D7Z6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Clca1Q9D7Z6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clca1Q9D7Z6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms