Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms