Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sec23bQ9D662 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sec23bQ9D662 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sec23bQ9D662 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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