Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ddx28Q9CWT6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ddx28Q9CWT6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ddx28Q9CWT6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ddx28Q9CWT6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ddx28Q9CWT6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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