Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms