Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS6

Gkn2, Gastrokine-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn2Q9CQS6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gkn2Q9CQS6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gkn2Q9CQS6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gkn2Q9CQS6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gkn2Q9CQS6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gkn2Q9CQS6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gkn2Q9CQS6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gkn2Q9CQS6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms