Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd2aQ9CQJ1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms