Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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