Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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