Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms