Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Sh3bp5lQ99LH9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
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Sh3bp5lQ99LH9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Sh3bp5lQ99LH9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Sh3bp5lQ99LH9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Sh3bp5lQ99LH9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Sh3bp5lQ99LH9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Sh3bp5lQ99LH9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Sh3bp5lQ99LH9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Sh3bp5lQ99LH9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Sh3bp5lQ99LH9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Sh3bp5lQ99LH9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Sh3bp5lQ99LH9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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