Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms