Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlcd1Q99JT6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms