Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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Smim11aQ99J19 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Smim11aQ99J19 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Smim11aQ99J19 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim11aQ99J19 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim11aQ99J19 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim11aQ99J19 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim11aQ99J19 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim11aQ99J19 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim11aQ99J19 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim11aQ99J19 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim11aQ99J19 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim11aQ99J19 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim11aQ99J19 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim11aQ99J19 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim11aQ99J19 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim11aQ99J19 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim11aQ99J19 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim11aQ99J19 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim11aQ99J19 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim11aQ99J19 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim11aQ99J19 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim11aQ99J19 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim11aQ99J19 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim11aQ99J19 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim11aQ99J19 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Smim11aQ99J19 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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