Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SptssbQ925E8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms