Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms