Protein–RNA interactions for Protein: Q921U8

Smtn, Smoothelin, mousemouse

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmtnQ921U8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmtnQ921U8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmtnQ921U8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmtnQ921U8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmtnQ921U8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmtnQ921U8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmtnQ921U8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmtnQ921U8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmtnQ921U8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmtnQ921U8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmtnQ921U8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmtnQ921U8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmtnQ921U8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmtnQ921U8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmtnQ921U8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmtnQ921U8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmtnQ921U8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmtnQ921U8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmtnQ921U8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmtnQ921U8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmtnQ921U8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmtnQ921U8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmtnQ921U8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmtnQ921U8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmtnQ921U8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SmtnQ921U8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SmtnQ921U8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmtnQ921U8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmtnQ921U8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmtnQ921U8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmtnQ921U8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmtnQ921U8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms