Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms