Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmcd1Q8VEE1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms