Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms