Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Vmn1r200Q8R281 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r200Q8R281 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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