Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vrk3Q8K3G5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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