Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Phf13Q8K2W6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms