Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Depp1Q8K2F3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms