Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb1Q8CBF3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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