Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Wfdc12-201ENSMUST00000051272 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Ranbp1-201ENSMUST00000052325 923 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm17910-201ENSMUST00000211038 838 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms