Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sall4Q8BX22 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sall4Q8BX22 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sall4Q8BX22 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sall4Q8BX22 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sall4Q8BX22 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sall4Q8BX22 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sall4Q8BX22 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sall4Q8BX22 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sall4Q8BX22 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sall4Q8BX22 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sall4Q8BX22 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sall4Q8BX22 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sall4Q8BX22 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sall4Q8BX22 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sall4Q8BX22 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sall4Q8BX22 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sall4Q8BX22 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sall4Q8BX22 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sall4Q8BX22 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms