Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSS9

Ppfia2, Liprin-alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia2Q8BSS9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia2Q8BSS9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms