Protein–RNA interactions for Protein: Q8BI41

Synb, Syncytin-B, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynbQ8BI41 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SynbQ8BI41 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynbQ8BI41 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SynbQ8BI41 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SynbQ8BI41 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynbQ8BI41 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynbQ8BI41 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SynbQ8BI41 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
SynbQ8BI41 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynbQ8BI41 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SynbQ8BI41 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms