Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ubash3bQ8BGG7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ubash3bQ8BGG7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ubash3bQ8BGG7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ubash3bQ8BGG7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ubash3bQ8BGG7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ubash3bQ8BGG7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ubash3bQ8BGG7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ubash3bQ8BGG7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ubash3bQ8BGG7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ubash3bQ8BGG7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ubash3bQ8BGG7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubash3bQ8BGG7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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