Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms