Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Sox11Q7M6Y2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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