Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms