Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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