Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx6Q6P8X1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms