Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2B1

Tnpo3, Transportin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo3Q6P2B1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnpo3Q6P2B1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms