Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms