Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Krt40Q6IFX3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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