Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc3Q64519 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms