Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Top2bQ64511 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms