Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc18Q640L5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
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