Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcncQ62447 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcncQ62447 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcncQ62447 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms