Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms