Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc9a1Q61165 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9a1Q61165 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms