Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms