Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3558Q5FWC9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms